Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
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CLDN9O95484 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CLDN9O95484 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CLDN9O95484 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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CLDN9O95484 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CLDN9O95484 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CLDN9O95484 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CLDN9O95484 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CLDN9O95484 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLDN9O95484 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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