Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
RFXAPO00287 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms