Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MIS18AQ9NYP9 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms