Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms