Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC025188.1-201ENST00000507514 600 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC234917.1-201ENST00000534006 316 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms