Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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