Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC092803.1-201ENST00000439570 359 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC007349.2-201ENST00000439998 553 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CRIP1P4-201ENST00000442565 229 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL157714.2-204ENST00000452283 973 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC108114.1-201ENST00000477321 437 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RN7SL482P-201ENST00000487928 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SCG5-206ENST00000494364 1148 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PGAM1P1-201ENST00000504014 556 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TPI1P4-201ENST00000513630 473 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC073896.5-201ENST00000546464 542 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL132719.1-201ENST00000554515 423 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL022318.2-201ENST00000558766 258 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ARL2BP-202ENST00000562023 547 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC015688.7-201ENST00000580276 664 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008734.2-201ENST00000595277 477 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008751.1-201ENST00000600438 342 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC174071.1-201ENST00000603069 517 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01206-219ENST00000625703 820 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC02086-204ENST00000628006 786 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL627171.2-202ENST00000634923 923 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CCDC190-201ENST00000367910 1498 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR1S1-202ENST00000641544 1474 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR3A1-201ENST00000323404 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TFDP2-209ENST00000477292 1403 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TAC1-203ENST00000350485 975 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PRR13-201ENST00000379786 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FCAR-206ENST00000391724 762 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC106017.1-202ENST00000424109 428 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL035411.1-201ENST00000427762 690 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC244205.2-201ENST00000434790 898 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC007952.3-202ENST00000435028 428 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC244098.1-201ENST00000436499 275 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IGHJ1P-201ENST00000450690 55 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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