Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SLC25A14P1-201ENST00000502867 901 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AMER1-201ENST00000330258 8443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MAN1A2-201ENST00000356554 8576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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HERC1Q15751 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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HERC1Q15751 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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HERC1Q15751 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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HERC1Q15751 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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