Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms