Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF2H3Q13889 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms