Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MTMR3Q13615 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms