Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CEACAM7-201ENST00000006724 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RXFP2-202ENST00000380314 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MTTP-208ENST00000511045 3154 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 FHL1-206ENST00000394153 2374 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LDB2-203ENST00000502640 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC024337.1-201ENST00000558860 1562 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MFSD8-207ENST00000513559 1813 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MAPK10-343ENST00000641677 2546 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 EIF4BP4-201ENST00000441847 1780 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SCMH1-210ENST00000402904 3204 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CLN3Q13286 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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CLN3Q13286 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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CLN3Q13286 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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CLN3Q13286 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC007731.3-201ENST00000458154 446 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CLN3Q13286 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC02121-201ENST00000507950 432 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC116348.2-201ENST00000563751 577 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF331-216ENST00000511593 1985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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