Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PGRMC2-202ENST00000394276 2858 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms