Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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