Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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PTPRMP28827 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
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