Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ERVV-1B6SEH8 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms