Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms