Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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