Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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GRIK4Q16099 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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