Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms