Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CYTH1Q15438 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms