Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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CHD4Q14839 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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