Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms