Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
TCOF1Q13428 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms