Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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