Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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