Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CENPFP49454 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CENPFP49454 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CENPFP49454 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CENPFP49454 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CENPFP49454 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CENPFP49454 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CENPFP49454 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CENPFP49454 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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CENPFP49454 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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CENPFP49454 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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CENPFP49454 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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