Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms