Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
MIS18AQ9NYP9 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms