Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC010615.2-206ENST00000593653 556 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IK-211ENST00000610522 737 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 JPX_1.1-201ENST00000614715 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.132-201ENST00000619251 285 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01727-204ENST00000624385 940 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TMEM45A-201ENST00000323523 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CCDC65-202ENST00000320516 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CPA2-201ENST00000222481 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR1G1-201ENST00000328890 998 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP208-201ENST00000365474 361 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GPN2-201ENST00000374133 715 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MTIF3-202ENST00000381120 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC007207.1-202ENST00000393388 498 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL024509.1-201ENST00000397093 927 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR4F7P-201ENST00000402444 931 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PPIAP29-201ENST00000414949 499 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC145543.1-201ENST00000424770 586 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL355310.1-201ENST00000436416 596 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IGKV1D-35-201ENST00000442736 271 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KRTAP19-10P-201ENST00000445258 187 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF337-AS1-206ENST00000455791 650 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 DCD-202ENST00000456047 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP11-201ENST00000486538 799 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC097460.1-202ENST00000507494 769 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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