Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 FAM83F-201ENST00000333407 15561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MYO5A-213ENST00000613858 12139 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MYO5A-202ENST00000358212 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MYO5A-206ENST00000399233 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 TENM2-207ENST00000520394 8034 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CACNB2-209ENST00000396576 4464 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 BACH2-201ENST00000257749 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 FAM71F2-205ENST00000641605 5749 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ARID1B-232ENST00000637904 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 OR4D9-203ENST00000641962 6123 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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