Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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