Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRIP13Q15645 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms