Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SS18Q15532 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SS18Q15532 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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