Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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