Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms