Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PICALMQ13492 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms