Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms