Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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LRRTM2O43300 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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