Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SNX15Q9NRS6 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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SNX15Q9NRS6 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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SNX15Q9NRS6 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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SNX15Q9NRS6 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SNX15Q9NRS6 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNX15Q9NRS6 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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