Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms