Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC084871.2-201ENST00000503355 464 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC108120.1-201ENST00000506543 991 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RNF11P2-201ENST00000427702 440 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms