Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms