Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms