Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms