Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 GCSAML-204ENST00000463359 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TCTE3-201ENST00000366774 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TRBV30-201ENST00000417977 447 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC01508-202ENST00000436671 755 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZFAND1-214ENST00000521287 772 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 C8orf87-201ENST00000521906 588 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC005479.1-201ENST00000554629 451 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ETFRF1-210ENST00000556927 833 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR4F7P-201ENST00000402444 931 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR4F1P-201ENST00000405102 938 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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