Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TECPR2-201ENST00000359520 8686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 OR5H1-202ENST00000641874 5999 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SHPRH-206ENST00000438092 6994 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AFF2-205ENST00000370460 13746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PRDM10-207ENST00000528746 6182 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 TAF8-201ENST00000372977 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 FRMPD2-201ENST00000305531 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LIMCH1-202ENST00000381753 5705 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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