Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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