Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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