Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC01184-206ENST00000508878 968 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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